消化炉在蛋白质检测中起到了很重要的作用，选择一台合适的消化炉是准确检测的前提。可以根据用户的需要选择不同的热载体。比如石英辐射、铝锭、石墨等。

1、石英红外加热，靠热辐射来加热样品。
特点是：升温快，热惯性小，温控。一般应用于有高要求样品的消化。例如：有较快的升温和降温速度。程序升温使用户，根据样品的特点来选择升温曲线，或选择分段式的升温，有利于样品的消化，从而减少样品挂壁现象、使得样品消化率大大提高。但早期的石英盒由于电阻丝不密闭，在酸雾环境下易被腐蚀，换石英盒是不能避免的“痛"。
 

2、铝锭加热，靠铝锭传导热能给样品。
特点：升温较慢，热惯性较大，温度较稳定，还由于铝锭的良好的热传导性，每个样品孔间的温度一致性较好，由于电加热处于密闭状态，酸雾不会影响加热部分，且铝和硫酸反应也只是表面产生硫酸铝，不会深入腐蚀。广泛应用于消化炉的热载体，但也要注意：一片薄薄的铝锭也不能保持温度的恒定，所以选择铝锭消化炉，铝锭厚度也是一个考察指标。
 

3、石墨加热，靠石墨传导给样品热量。
特点：热惯性大，升温慢，由于石墨热传导性较差（相比较铝锭），使得样品孔间温度不均匀，容易造成样品间消化时间差较大，由此样品消化时间较长。影响数据的性。但是由于石墨材料成本低（相对于铝锭），优点：石墨消化炉成本便宜，且石墨对硫酸不起反应。对部分低端用户有一定的吸引力。